תהליך ליווי מעמיק הוא תהליך מתמשך שבו אנו הולכים עם הגננת, הרשות ונציגי משרד החינוך (הפיקוח) "יד ביד" בכל שלבי תהליך הקמת מסגרת חינוכית בטבע, עד הרגע שבו הגננת או המוסד החינוכי מרגישים שיש להם את כל הכלים הנדרשים על מנת להמשיך בדרכם באופן עצמאי. תהליך הליווי המעמיק הינו תהליך שנמשך על פי רוב כשנתיים או שלוש, ובו הגננת השותפה לתהליך מתבקשת לקחת חלק בקורס מתקדם לגני יער, ולהגיע לפחות ליום תצפית אחד בגן המדגים במצפה רמון, על מנת לייצר שפה משותפת שתלווה אותנו לאורך כל הדרך. המלווה החינוכי לוקח חלק בכל השלבים הקשורים בהקמת מסגרת חינוכית מסוג זה, החל משלב חיפוש השטח, חיפוש אנשי הצוות המתאימים (אם יש צורך), ועבודה עמם ועם הרשות לאורך כל הדרך, לפתירת האתגרים המתעוררים ועולים עד ליציאה לדרך עצמאית.